Nhóm nghiên cứu Covid-19 của Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới TP HCM và Đơn vị Nghiên cứu Lâm Sàng Đại Học Oxford vừa tiến hành giải mã nhanh bộ gene của SARS-CoV-2 từ bệnh nhân 4514. Đây là ca Covid-19 cư ngụ tại chung cư SunView Town (TP Thủ Đức, TP HCM) được ghi nhận hôm 18-5 và được Bộ Y tế công bố chính thức vào sáng nay 19-5.
Một công đoạn trong quy trình xét nghiệm SARS-CoV-2 tại Bệnh viện Bệnh Nhiệt Đới TP HCM (Ảnh: HOÀNG TRIỀU)
TS-BS Nguyễn Văn Vĩnh Châu, Giám đốc Bệnh viện Bệnh Nhiệt Đới TP HCM - đại diện nhóm nghiên cứu, cho biết nhóm đã sử dụng mẫu RNA được tách chiết từ mẫu phết hầu họng của bệnh nhân 4514 vào ngày 18-5, thực hiện giải mã gene bằng kỹ thuật Illumina MiSeq và MinION, với phần mềm lắp ghép bộ gene Genious.
Kết quả định danh bằng phần mềm Pangolin cho thấy bộ gene thu được thuộc biến chủng B.1.617.2. Kết quả xác định đột biến bằng COV-GLUE ghi nhận bộ gene mang 6 đột biến thay đổi aminoacid tiêu biểu (T19R, L452R, T478K, D614G, P681R, D950N) và một đột biến đứt đoạn (156-158) trên vùng protein gai của biến chủng B.1.617.2.
Điều này đưa đến kết luận: Bệnh nhân 4514 nhiễm biến chủng B.1.617.2 tương tự biến chủng đang gây dịch tại một số nơi ở phía Bắc.
Biến chủng B.1.617.2 chính là một trong 3 phân nhánh con của biến chủng B.1.617 từ Ấn Độ. Theo TS-BS Nguyễn Văn Vĩnh Châu, biến chủng B.1.617.2 này mang đột biến kép là L452R và T478K.
Đột biến T478K cũng được dự báo có khả năng ảnh hưởng đặc biệt đến ái lực của protein gai với thụ thể ACE2 và làm cho virus dễ dàng nhanh chóng xâm nhập tế bào hơn.
Đầu tháng 5 vừa qua, Anh quốc tuyên bố biến chủng B.1.617.2 là biến chủng đáng lo ngại tại quốc gia này.
